Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMCO5BA8MYB1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO5BA8MYB1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMCO5BA8MYB1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMCO5BA8MYB1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms