Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C4orf47A7E2U8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms