Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNCNA6PVL3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms