Protein–RNA interactions for Protein: A6NM36

LRRC30, Leucine-rich repeat-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC30A6NM36 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRC30A6NM36 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC30A6NM36 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC30A6NM36 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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