Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF25A6NGN4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms