Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB7

TMEM221, Transmembrane protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM221A6NGB7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM221A6NGB7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM221A6NGB7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM221A6NGB7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms