Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNDIG1LA6NDD5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms