Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS37CA5D8V6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37CA5D8V6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms