Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB19A4D1S5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB19A4D1S5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB19A4D1S5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms