Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV5S1A1TA0A578 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCRBV5S1A1TA0A578 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCRBV5S1A1TA0A578 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms