Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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