Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SH3BP1Q9Y3L3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SH3BP1Q9Y3L3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SH3BP1Q9Y3L3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SH3BP1Q9Y3L3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SH3BP1Q9Y3L3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SH3BP1Q9Y3L3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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