Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms