Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP9

GULP1, PTB domain-containing engulfment adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GULP1Q9UBP9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GULP1Q9UBP9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GULP1Q9UBP9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GULP1Q9UBP9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GULP1Q9UBP9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GULP1Q9UBP9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GULP1Q9UBP9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GULP1Q9UBP9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GULP1Q9UBP9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GULP1Q9UBP9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GULP1Q9UBP9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GULP1Q9UBP9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GULP1Q9UBP9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GULP1Q9UBP9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GULP1Q9UBP9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms