Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms