Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms