Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRTQ9BXP5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms