Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms