Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms