Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms