Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms