Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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COPS9Q8WXC6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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COPS9Q8WXC6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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COPS9Q8WXC6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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COPS9Q8WXC6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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COPS9Q8WXC6 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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COPS9Q8WXC6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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COPS9Q8WXC6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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COPS9Q8WXC6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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