Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C9orf40Q8IXQ3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C9orf40Q8IXQ3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C9orf40Q8IXQ3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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