Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms