Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms