Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms