Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 564.5 ms