Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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C10orf55Q5SWW7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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C10orf55Q5SWW7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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C10orf55Q5SWW7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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C10orf55Q5SWW7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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C10orf55Q5SWW7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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C10orf55Q5SWW7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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