Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCTE1Q5JU00 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms