Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 IFFO1-205ENST00000436152 3101 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC092335.1-201ENST00000509037 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms