Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PKDCCQ504Y2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms