Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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