Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms