Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms