Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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TRIP13Q15645 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TRIP13Q15645 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TRIP13Q15645 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TRIP13Q15645 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TRIP13Q15645 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TRIP13Q15645 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms