Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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