Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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