Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms