Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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