Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NFIXQ14938 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NFIXQ14938 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NFIXQ14938 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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NFIXQ14938 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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NFIXQ14938 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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NFIXQ14938 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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NFIXQ14938 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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