Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HNF4GQ14541 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms