Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TUBA3CQ13748 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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TUBA3CQ13748 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TUBA3CQ13748 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TUBA3CQ13748 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TUBA3CQ13748 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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