Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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