Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CAMK2DQ13557 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CAMK2DQ13557 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CAMK2DQ13557 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CAMK2DQ13557 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CAMK2DQ13557 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CAMK2DQ13557 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms