Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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