Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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