Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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IFT88Q13099 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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IFT88Q13099 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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IFT88Q13099 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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IFT88Q13099 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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IFT88Q13099 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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IFT88Q13099 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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IFT88Q13099 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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IFT88Q13099 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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IFT88Q13099 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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