Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms