Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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