Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms